Comandos apt-get clean e autoclean

sudo apt clean

O apt-get clean remove tudo exceto os arquivos de lock dos diretórios /var/cache/apt/archives/ e /var/cache/apt/archives/partial/. Assim, se você precisar reinstalar um pacote o APT irá buscá-lo novamente.

sudo apt autoclean

O apt-get autoclean remove apenas os arquivos de pacotes que não possam mais ser baixados.